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SCIENCES

Laboratoire de biologie du développement de Villefranche/mer - UMR 7009

L'Unité Mixte de Recherche "Biologie du Développement" (UMPC/CNRS) est implantée à l'Observatoire Océanologique de Villefranche-sur-Mer . Elle fait suite à plusieurs équipes de biologie fondamentale travaillant dans les domaines de biologie cellulaire et de biologie du développement, présentes depuis presque 30 ans à l'Observatoire.

Les activités de recherche de l'unité actuelle sont essentiellement orientées vers l'étude du développement embryonnaire. Plusieurs grandes thématiques sont abordées : la régulation de la méiose, la régulation des divisions asymétriques, la localisation des ARNm dans l’œuf et l’embryon, le rôle des ARNm localisés dans le patterning de l’embryon, le rôle des voies de signalisation intercellulaire dans la régionalisation de l'embryon  précoce,  la mise en place des axes embryonnaires, l’élaboration de réseaux de régulation géniques, et la spécification des destins cellulaires

Dans cette page

Activités de recherche

Culture d'organismes et d'embryons d’espèces modèles traditionnels et de nouveaux modèles marins.

Travaux ponctuels sur  d’autres espèces, en exploitant la diversité unique de la Rade de Villefranche

Identification  de nouveaux  acteurs moléculaires du développement précoce  (biochimie, clonages, séquençage, criblages, hybridations in situ, etc...)

Etudes fonctionnelles des régulateurs de gamétogènese et d’embryogenèse précoce ; Elaboration des réseaux de régulation géniques.

Génération et analyses de séquences génomiques pour les modèles marins principaux : l’oursin Paracentrotus  lividus;  l’ascidie Phallusia mamilata ; la méduse Clytia hemisphaerica.

Imagerie in vivo de protéines « taggées » fluorescentes, du calcium et d’autres indicateurs physiologiques, des organites et du cytosquelette (microscopie confocale et vidéomicroscopie, vidéo rapide, analyse d'images).

Visualisation et localisation des structures cellulaires et macromoléculaires (microscopie électronique, cryodécapage, immunolocalisations, hybridations in situs)

Mots-clés

embryons marins, determinants embryonnaires, réseau de régulation génique, division cellulaire asymetrique

Equipes et thématiques de recherche

* « Déterminants Maternels » (responsable : Evelyn Houliston)

Cette équipe s'intéresse aux "déterminants"  localisés dans les oeufs : leur nature, leur fonction et les mécanismes cellulaires responsables de leur répartition différentielle au sein de la cellule et dans l’embryon.

L’espèce  principale de travail  est la petite méduse Clytia hemisphaerica, un nouveau modèle expérimental développé au laboratoire. L'amphibien Xenopus laevis est également utilisé, pour des études comparatives.

 

* « Mécanismes de spécification et voies de signalisations chez l'oursin  » (responsable : Thierry Lepage)

Le but de cette équipe est de mieux comprendre le rôle des voies de signalisation et des interactions cellulaires au cours du développement  précoce.  Elle étudie plus particulièrement les questions suivantes:

- La  formation des axes embryonnaires (axes animal végétatif , dorso-ventral , gauche-droite)

- La  formation et la régionalisation des  feuillets embryonnaires  (mésoderme et endoderme)

- Les processus morphogénétiques de la gastrulation (migration du mésoderme, gastrulation)

Cette équipe utilise principalement l'oursin  Paracentrotus lividus, mais également le poisson zèbre .

 

* « Régionalisation et morphogenèse de l'embryon d'oursin « (responsable : Christian Gache)

 Cette  équipe étudie les mécanismes moléculaires et cellulaires contrôlant la spécification et la morphogenèse des lignées cellulaires végétatives de l'embryon d'oursin Paracentrotus lividus, l'endoderme et le mésoderme.

Elle s'attache plus particulièrement à identifier la nature des voies de signalisation (Notch, Wnt, VEGF, etc…) et facteurs de transcription (Brachyury, FoxA, GataE, SoxC, etc…) qui régulent ces processus embryonnaires. Notre but final est d'établir un modèle à 4 dimensions incluant données moléculaires et événements cellulaires impliqués dans ces mécanismes.

 

* Fécondation et contrôle du cycle méiotique  (responsable : Alex McDougall)

    Cette équipe poursuit actuellement deux volets de recherche :

1) La régulation du cycle cellulaire au cours de la maturation méiotique des ovocytes et la ségrégation des chromosome lors des cycles de division méiotique. 

2) La génération des oscillations calciques dans l’oeuf induites par l’entrée du spermatozoïde.  

Ses principaux modèles de travail sont les ascidies Ciona intestinalis et Phallusia mammilata

 

* Equipe BioMarCell : Fécondation et polarisation des embryons d'invertébrés  marins (responsable : Christian Sardet)

Cette équipe s’intéresse aux mécanismes responsables de la polarisation cellulaire et du développement embryonnaire précoce chez les ascidies. Ses recherches actuelles portent sur les mécanismes impliqués dans

-1) L’acquisition de la polarité primaire de l’ovocyte pendant la maturation méiotique.

-2) La polarisation du zygote après fécondation et ses conséquences sur la mise en place des axes du têtard.

-3) La répartition polarisée du cytosquelette, d’organites et d’ARNm corticaux et la régulation de leur traduction.

-4) Les patrons de divisions cellulaires asymétriques au pôle postérieur impliqués dans l’établissement des lignées germinales et musculaires.

 

* « Spécification des précurseurs embryonnaires  » (Hitoyoshi Yasuo)

Cette équipe analyse les mécanismes cellulaires et moléculaires responsable du destin cellulaire chez l’embryon de l’ascidie, Ciona intestinalis . Elle étudie plus particulièrement l’origine de deux des structures clefs qui caractérisent le phylum Chordata, le  notochorde  et le tube neural.

Projets en cours

ANR – Equipe  Lepage : Dissection of the dorsal-ventral Gene regulatory Network in the sea urchin embryo. (acronyme : DVNETWORK), 01/01/2009 au 31/12/2012 (48 mois)

 ANR - Equipe MacDougall (Collaboration avec M-H Verlhac, UMPC UMR 7022 responsable) : A proteomic approach of meiotic divisions of oocytes (acronyme  MetaOneProteome), 01/01/2009 au 31/12/2012 (48 mois)

 

ANR - Equipe Yasuo : Dissection of developmental processes leading to the chrodate body plan (acronyme : ChordateForm), automne 2009 (48 mois)

ANR - Equipe Houliston (Collaboration avec M  Manuel, UMPC, UMR7138, responsable). L’origine des processus fondamentaux du développement animal : approche évo-dévo sur les modèles émergents Clytia hemisphaerica (cnidaire) et Pleurobrachia pileus (cténaire) (acronyme : DiploDevo), automne 2009 (36 mois)

 

ARC  équipe Lepage : Rôles du répresseur transcriptionnel Yan/Tel6 et de son modulateur Mae dans le contrôle de la transition épithélium mésenchyme et l’établissement de la polarité dorso-ventrale. 08/01/2008 (24 mois)

ARC  équipe Sardet-ARN et protéines corticales : rôles dans la polarisation et la différenciation cellulaire. 08/01/2008 (24 mois)  

ARC équipe Yasuo-  Les divisions cellulaires asymétriques comme mécanisme de génération de diversité cellulaire au cours de l’embryogenèse des chordés. 11/12/2008 (24 mois)

ARC- équipe Houliston (resp. T. Momose)  Rôles et interactions des voies Wnt/Fz canoniques dans le développement embryonnaire. 11/12/2008 (24 mois

Emergence-Sorbonne Université – Equipe Gache (resp. J. Croce) Dynamique des réseaux de gènes régulateurs du développement embryonnaire : spécification de l’endoderme et du mésoderme chez l’embryon d’oursin. 01/03/2010 (24 mois)

Avancées scientifiques, résultats marquants

Thierry Lepage,* Directeur de recherche CNRS dans notre UMR,  s'est vu attribuer le Prix Tregouboff par l'Académie des sciences en 2009: Ce Prix quadriennal récompense ses récentes découvertes sur les mécanismes de spécification des axes embryonnaires chez l'oursin.

Clare Hudson, Chargée de Recherche dans notre UMR, a reçu le 15 septembre 2009 la médaille de bronze du CNRS pour son travail sur les larves d'ascidies des mécanismes fondamentaux qui régulent le développement embryonnaire. (voir : http://www.webtimemedias.com/webtimemedias/wtm_article53337.fr.htm)

Ecoles doctorales

ED 85 Biologie et Pharmacologie Moléculaires (UNSA)

ED 223 Complexité du vivant (Sorbonne Université)

ED 392 Diversité du Vivant (Sorbonne Université)

 

Partenariats scientifiques
Locaux

 

La plate forme ImarioNice (Site :http://biodev.obs-vlfr.fr/imarionice) est une entité en cour de labellisation « Ibisa », les équipements sont distribués sur deux plateaux techniques situés à Nice Varose et à Villefranche/mer. Elle offre à ses utilisateurs, l’accès aux techniques d’observations suivantes :

Microscopie non-linéaire.

  • La microscopie multi-photon : technique de microscopie de fluorescence qui permet d’imager des échantillons tridimentionnellement avec une profondeur d’illumination de plus de 500um),
  • Microchirurgie laser : permet de détruire de manière extrêmement contrôlée un objet biologique (résolution inférieure au micron) et d'observer la réaction de l’échantillon à cette ablation
  • Génération de Seconde Harmonique : technique de contraste spécifique de certaines molécules avec une organisation très structurée (fibres de collagène, myosine sarcomérique,…)

Microscopie confocale à balayage laser.

Microscopie photonique offrant la possibilité d'accéder à l'information tri-dimensionnelle en fluorescence, d'un échantillon microscopique. Possibilités de mettre en oeuvre différentes techniques de photo-manipulation (FRET, FRAP, Photo activation décageage...)

Vidéomicroscopie à champ large

Permet l'étude de la dynamique cellulaire. Cette technique permet notamment d'observer en images par image à des vitesses d'observation élevées (dépendant du signal de l'échantillon)

Microscopie de déconvolution

Technique d'imagerie utilisant des techniques d'analyse d'images afin de faire du Z-sectionning à partir d'images de videomicroscopie.

Microscopie ratiométrique

Par épifluorescence.

Stations de post traitement

Afin de mettre en accès aux utilisateurs des outils d'analyse d'images

Nationaux

Avec le Génoscope /IBISA  pour les projets  de séquençage sur nos principales espèces modèles :

 

Clytia hemisphaerica : Séquencage du génome complète

Phallusia mammilata : Séquencage du transcriptome

Paracentrotus lividus: Séquencage du transcriptome et de l’ADN génomique

Principales publications

Pour la liste complète, voir la base de données du laboratoire  

Tutelle principale

Sorbonne Université

Autres tutelles

CNRS

Coordonnées
Coordonnées
Directeur
HOULISTON Evelyn
04 93 76 37 91
evelyn.houliston@upmc.fr
Adresse physique
Observatoire Océanologique de Villefranche
Quai de la Darse
BP 48 6235
Villefranche-sur-Mer Cedex

Courriel du laboratoire
Site web
http://biodev.obs-vlfr.fr/
Adresse postale
UMR 7009 CNRS/UMPC
Observatoire Océanologique,
F-06230 Villefranche-sur-mer.

Contact communication
KHAMLA Mohamed
04 93 76 37 73
khamla@obs-vlfr.fr
Contact administratif
GOMEZ Anne Marie
04 93 76 37 70
biodev@obs-vlfr.fr


Effectifs
Enseignants-chercheurs :
1

Chercheurs :
14

Personnels d'appui à la recherche :
14

Post-doctorants :
3

Doctorants :
6

Christian Gache - 29/12/17

Traductions :

Chiffres clés

La faculté des Sciences et Ingénierie compte :
79 laboratoires de recherche
21 fédérations de recherche
22 départements de formation
4 observatoires - l'Observatoire océanologique de Banyuls-sur-Mer - l'Observatoire océanologique de Villefranche-sur-Mer - l'Observatoire océanologique de Roscoff - l'Observatoire...

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Contact

Direction de la Recherche et de la Valorisation

Bruno BACHIMONT

 

Contact

Chargé (es) de Développement et de Partenariats.

Ils accompagnent les directeurs d’unités et les chercheurs dans la recherche de financement, la mise en œuvre de collaborations et, en lien avec la SATT Lutech, dans les activités de transfert

  • Informatique : Jules ESPIAU DE LAMAESTRE (jules.espiau_de_lamaestre @ upmc.fr)
  • Ingénierie : Francesca DAU (francesca.dau @ upmc.fr)
  • Maths/Physique : Olivia LEROY (olivia.leroy @ upmc.fr)
  • Chimie/Biologie : Laurène EL BAHHAJ (laurene.el_bahhaj @ upmc.fr)
  • Stations marines : Anaïs DESCLOS (anais.desclos @ upmc.fr)
  • Environnement : Anna LOURANTOU-PARIS (anna.lourantou-paris @ upmc.fr)

Contact

Coordination du pôle Terre vivante et environnement :


- Sébastien Duperron (sebastien.duperron @ upmc.fr) 
- Julien Gasparini (julien.gasparini @ upmc.fr)
- Marie-Noëlle Houssais (marie-noelle.houssais @ upmc.fr)
- Chrystèle Sanloup (chrystele.sanloup @ upmc.fr)

Terre vivante et environnement

  • 840 enseignants-chercheurs et chercheurs
  • 740 personnels d'appui à la recherche
  • 520 doctorants
  • 22 unités de recherche
  • 3 écoles doctorales