Recherche - [SV]

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La plupart des domaines de la biologie sont couverts par les laboratoires de l'UFR Sciences de la vie.
 

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Les laboratoires de recherche en Biologie

CRC / UMRS 1138

Le Centre de Recherche des Cordeliers (CRC), situé au cœur de Paris, développe une recherche fondamentale, translationnelle et clinique dans le domaine de la biologie et de la santé, en particulier dans les champs de la cancérologie, de l’immunologie, de l’étude du métabolisme et des grandes fonctions physiologiques de l’organisme.
Le CRC regroupe plus de 500 personnes travaillant dans 17 équipes réparties en trois départements et trois plateformes technologiques labellisées ISO9001. Il est dirigé par la professeure Jessica Zucman-Rossi, spécialiste en cancérologie et génomique des tumeurs.
Le CRC est placé sous les tutelles de Sorbonne Université, de l’Inserm, et de l'Université de Paris.  

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Le Centre de recherche de l'Institut Curie rassemble plus de 1 100 collaborateurs sur trois sites : Paris, Orsay et St-Cloud. La recherche menée en cancérologie à l’Institut Curie, tant en recherche fondamentale qu’appliquée, est des plus innovantes en Europe. Une excellence, fruit de la collaboration entre équipes de l’institut mais aussi avec d’autres acteurs, en France ou à l’international.

Quatre unités de l'Institut Curie sont sous tutelle de l'UFR Sciences de la vie.

  • Biologie cellulaire et cancer / UMR 144

La mission de cette unité est de comprendre la biogenèse des compartiments cellulaires et les mécanismes moléculaires qui régissent les fonctions cellulaires normales.

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  • Génétique et biologie du développement / UMR 3215

L’unité de recherche « Génétique et Biologie du Développement » de l’Institut Curie se compose de neuf équipes abordant des questions fondamentales relatives au développement des organismes et à ses dérèglements pathologiques.
L'action de ce laboratoire est fondée sur une notion simple : l’étude du développement et de l’homéostasie des tissus est la clé pour une meilleure compréhension des pathologies.
Ses équipes étudient le vivant à plusieurs échelles allant des organismes (souris, poisson zèbre, drosophile) aux aspects moléculaires, en passant par les organoïdes, les xénogreffes de patient ou les lignées cellulaires. Cette variété d’approches permet une analyse intégrée depuis le noyau porteur de l’information génétique jusqu’à l’organisme dans son entier.

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  • Dynamique de l'information génétique / UMR 3244

Les équipes de cette unité ont pour objectif de mieux comprendre les mécanismes de maintenance de l’intégrité du génome, tels que la réplication, la réparation et la recombinaison, ainsi que le rôle des mécanismes de contrôle du cycle cellulaire et de l’expression génomique non codante dans la maintenance de l’épigénome.
Une grande diversité de modèles expérimentaux est utilisée, allant de la levure à la cellule humaine, en passant par la souris. De même, des méthodologies expérimentales très vairées sont employées, y compris des approches génétiques, cytogénétiques et en biologie moléculaire et cellulaire, le peignage d’ADN et les méthodes de séquençage à haut débit d’ADN et ARN, directes ou après immunoprécipitation de chromatine, afin de caractériser les réponses aux troubles de la maintenance génomique.

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  • Dynamique du noyau / UMR 3664

Les équipes de cette unité s’intéressent aux relations entre information génétique et épigénétique au cours du développement, lors de la mise en place des destins cellulaires propres à chaque lignée de l’organisme. Il s’agit aussi de comprendre comment ces informations sont altérées en contexte pathologique comme le cancer.
Pour ce faire, des modèles expérimentaux de choix, (drosophile, xénope, souris, levure) et lignées cellulaires (humaines, rongeurs…) sont exploités. Les objectifs de ce laboratoire visent à comprendre comment la réplication de l’ADN et sa réparation, ainsi que la transcription et la répression de l’expression des gènes, sont modulés au cours du développement, de la division cellulaire et en réponse à des stress génotoxiques et environnementaux.

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L’Institut de biologie Paris-Seine (IBPS - FR3631) concentre l’ensemble de la recherche en biologie du campus Pierre et Marie Curie, au sein de Sorbonne Université (SU), où cette discipline a occupé de tout temps une place centrale. Situé dans le bâtiment du Quai St-Bernard au bord de la Seine, l’IBPS regroupe plus de 500 personnes réparties dans 5 unités et 7 plateformes technologiques.

Quatre unités de l'IBPS sont sous tutelle de l'UFR Sciences de la vie.

  • Laboratoire de biologie computationnelle et quantitative / UMR 7238

Le Laboratoire de Biologie Computationnelle et Quantitative (LCQB) est un laboratoire interdisciplinaire travaillant à l'interface entre la biologie et les sciences quantitatives. Il est construit pour promouvoir une interaction équilibrée des approches théoriques et expérimentales en biologie et pour favoriser la définition de nouvelles questions expérimentales, l'analyse des données et la modélisation des phénomènes biologiques.
Les projets du laboratoire abordent des questions sur les structures et processus biologiques à travers la réalisation d’expériences de génomique fonctionnelle, d’ingénierie des génome et de biologie synthétique sur des organismes modèle (levure, micro-algue et bactérie), le séquençage des génomes, la génération in silico de nouvelles données biologiques qui restent aujourd'hui inaccessibles aux expériences, la modélisation mathématique et physique des systèmes biologiques, le développement de méthodes statistiques pour les données l'analyse, et la conception d'algorithmes originaux visant à des prédictions.

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  • Laboratoire de biologie du développement / UMR 7622

Le Laboratoire de Biologie du Développement (LBD) étudie le développement à de multiples échelles, de la molécule à l'organisme. Les équipes du laboratoire utilisent une variété d'organismes modèles associés à des approches intégrées, quantitatives et interdisciplinaires.
Le LBD s'appuie sur son expertise de longue date dans de nombreux aspects de la biologie du développement intégrative, en utilisant une grande variété d'organismes modèles : le nématode C. elegans, la Drosophile, le poisson-zèbre, le Xénope, le poulet, la souris et les plantes. Plusieurs groupes travaillent également sur des cellules et tissus humains. Le laboratoire est fermement orienté vers une vision moderne, quantitative et interdisciplinaire de la biologie du développement.

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  • Neurosciences Paris Seine / UMR 8246

Les équipes du laboratoire Neuroscience Paris Seine (NPS) étudient les fonctions cérébrales à différents niveaux, dans une vision intégrative, de la molécule au comportement. Leurs approches expérimentales complémentaires permettent de décrire et de manipuler la structure et la fonction des synapses et des circuits nerveux (incluant les cellules gliales et le couplage neuro-vasculaire).
Le laboratoire aborde des questions de développement neural, de plasticité et de régénération, ainsi que la dynamique des circuits neuronaux et du comportement, les altérations des circuits sous-jacents aux maladies psychiatriques et neurologiques, et enfin l'impact social et environnemental sur les fonctions cérébrales. En utilisant des modèles animaux pour divers troubles neurologiques ou psychiatriques, ces équipes visent à découvrir les mécanismes de base qui sous-tendent la physiopathologie de ces troubles.

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  • Adaptation biologique et vieillissement / UMR 8256

L'unité B2A-IBPS développe une ligne de recherche innovante et originale pour comprendre les facteurs contrôlant le vieillissement sain et la vulnérabilité aux maladies liées à l'âge. Ainsi, l'activité de l'unité s'inscrit dans le cadre de recherches fondamentales et translationnelles visant à repousser les frontières des connaissances sur les changements de l'adaptation cellulaire à une gamme de facteurs de stress tout au long de la vie, qui à leur tour induisent le vieillissement au niveau moléculaire, cellulaire et de l'organisme entier.
Ces investigations se déroulent dans un large éventail de modèles, des cultures cellulaires aux modèles animaux in vivo et aux études cliniques. Bien que fondamentales par nature, les recherches du laboratoire visent à accroître les connaissances pouvant être appliquées à la gestion des troubles liés au vieillissement ainsi qu'au développement de stratégies de modulation thérapeutique potentielle par prévention, réparation et renouvellement.

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L'Institut de Biologie Physico-Chimique (IBPC) détient une vocation pluridisciplinaire de promouvoir des recherches dans tous les domaines de la Biologie. Les bases structurales, génétiques et physico-chimiques du vivant sont étudiées à leurs différents niveaux d'intégration, de la molécule à l'organisme.
L'IBPC est un lieu de recherche ouvert sur la communauté scientifique internationale, qui promeut des travaux guidés par la curiosité scientifique et réalisés dans une atmosphère de liberté intellectuelle.

Deux unités de l'IBPC sont sous tutelle de l'UFR Sciences de la vie.

  • Biologie du chloroplaste et perception de la lumière chez les micro-algues / UMR 7141

Le LBCPLM est un laboratoire dédié à l’étude des processus induits par la lumière (photosynthèse et photoperception) et de la biologie du chloroplaste. L’UMR 7141 aborde des questions clés sur la biologie, l’évolution et l’écologie des micro-algues en se concentrant sur différentes espèces modèles (p. ex. Chlamydomonas reinhardtii et Phaeodactylum tricornutum) et sur des espèces phytoplanctoniques d’importance écologique, étudiés avec des approches écophysiologiques, biophysiques, biochimiques, génomiques et génétiques.
Le laboratoire  comporte une vingtaine de membres permanents (chercheurs, enseignants-chercheurs, ingénieurs, techniciens et administratifs) et une quinzaine de collaborateurs temporaires, doctorants et post-doctorants.

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  • Laboratoire de biologie moléculaire et cellulaire des eucaryotes / UMR 8226

Le laboratoire de Biologie Moléculaire et Cellulaire des Eucaryotes (LBMCE) développe des projets de recherche ayant pour objectif de comprendre les mécanismes moléculaires fondamentaux des organismes unicellulaires eucaryotes, tels que la levure Saccharomyces cerevisiae ou l'algue verte unicellulaire Chlamydomonas reinhardtii, par des approches multidisciplinaires.
Ses équipes combinent la génétique, la biologie moléculaire et cellulaire, la biochimie, la protéomique, la biophysique, la biologie structurale et la modélisation mathématique.  Ce laboratoire s'intéresse en particulier à la dynamique des organites, à la plasticité du génome linéaire et à la maturation des macromolécules d'ARN et des protéines.

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IFM / UMRS 1270

L'Institut du Fer à Moulin (IFM) est un centre de recherche de l’INSERM et de Sorbonne Université, consacré à l'étude du développement et de la plasticité du système nerveux.
L’IFM est actuellement composé de 8 équipes de recherche abordant des thématiques complémentaires portant sur les cellules souches, le développement du cortex cérébral, la neurotransmission et la signalisation, la plasticité des réseaux corticaux et la mémoire. Ces équipes mettent en œuvre des approches multidisciplinaires, de la molécule au comportement. Les recherches menées à l’IFM ont des applications médicales multiples dans le cadre des maladies neurologiques et psychiatriques telles que les troubles neurodéveloppementaux, l’épilepsie, les mouvements anormaux, les maladies neurodégénératives, la dépression et l’addiction. L’IFM est doté de plateformes scientifiques et techniques performantes pour l’imagerie cellulaire et tissulaire, le phénotypage des rongeurs et l’ingénierie cellulaire.

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Les 12 unités de recherche de la Faculté de Médecine sont associées à l'UFR Sciences de la vie.

  • Institut du cerveau et de la moelle épinière / UM 75

L’Institut du Cerveau et de la Moelle épinière (ICM) est un centre de recherche de dimension internationale réunissant en un même lieu malades, médecins et chercheurs. L’objectif étant de permettre la mise au point rapide de traitements pour les lésions du système nerveux afin de les appliquer aux patients dans les meilleurs délais.
L’Institut du Cerveau – ICM est un pôle d’excellence pour le système nerveux central, implanté au coeur de l'hôpital de la Pitié-Salpêtrière à Paris.

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  • Institut de la vision / UM 80

L’Institut de la Vision (SU/INSERM/CNRS) dirigé par le Pr Sahel a pour objectifs de comprendre les bases de notre vision, développer des approches thérapeutiques pour prévenir les pathologies oculaires et restaurer la vision de patients devenus aveugles. Les pathologies ciblées intègrent notamment les maladies héréditaires de la rétine, la dégénérescence maculaire liée à l’âge, le glaucome, la rétinopathie diabétique ou l’œil sec.
Ce centre de recherche accueille des cliniciens, biologistes, physiciens et mathématiciens pour le développement de projets pluridisciplinaires comme la modélisation des pathologies ou la production de systèmes diagnostiques.

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  • Maladies génétiques d’expression pédiatrique / UMRS 933

L'UMRS 933 (lnserm/Sorbonne Université) développe ses activités de recherche autour de 3 groupes de maladies génétiques : les maladies auto­inflammatoires, des maladies pulmonaires (dyskinésies ciliaires primitives et fibroses pulmonaires idiopathiques) et certaines maladies du développement (retards de croissance, déficits intellectuels syndromiques et anomalies du développement sexuel).
Les objectifs sont d'identifier les bases moléculaires et cellulaires de ces maladies et de tirer parti de l'élucidation des mécanismes physiopathologiques en cause pour ouvrir de nouvelles pistes thérapeutiques.

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  • Centre de recherche Saint-Antoine / UMRS 938

Le Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA) regroupe un très fort potentiel pour la recherche biomédicale à la fois fondamentale et translationnelle. Les travaux de recherche sont réalisés en collaboration avec les services cliniques et biologiques des hôpitaux St-Antoine –Tenon – Trousseau. Le CRSA est composé de 13 équipes de recherche labelisées par l’Inserm et Sorbonne Université, localisées principalement sur le site de l’hôpital Saint-Antoine et de l’hôpital Armand Trousseau.
La recherche du CRSA est axée sur deux thématiques scientifiques étroitement liées : la recherche en cancérologie et hématologie ; et la recherche sur le métabolisme et l’inflammation. Ces thématiques sont étudiées au niveau fondamental, physiopathologique, préclinique et clinique.

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  • Immunologie immunopathologie immunothérapeutique / UMRS 959

Le laboratoire Immunologie-Immunopathologie-Immunotherapie (i3) est consacré à l'immunologie des systèmes translationnelle.
Il a comme objectif heuristique de contribuer à l'avancement des connaissances fondamentales en immunologie et comme objectif appliqué de développer des immunothérapies innovantes contre les maladies auto-immunes & inflammatoires et l’allergie. Ainsi, i3 met en œuvre des approches de biologie des systèmes pour analyser la complexité des interactions cellulaires et des régulations au cours des réponses immunitaires et en thérapeutique. i3 maîtrise les analyses de données complexes en cytomique, génétique, metagénomique microbienne, transcriptomique et protéomique, et a une expertise particulière pour l’analyse du répertoire TCR des lymphocytes T.
i3 réunit des immunologistes, des cliniciens, des bioinformaticiens, des mathématiciens, des informaticiens et des statisticiens qui apportent les compétences multidisciplinaires nécessaires à son ambition.

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  • Centre de recherche en myologie / UMRS 974

 Le Centre de Recherche en Myologie est un pôle de recherche multidisciplinaire sur le muscle et ses pathologies.
L’objectif de l’UMRS 974 est de développer des approches innovantes de thérapies cellulaires, géniques ou pharmaco-géniques, fondées sur la compréhension de la physiopathologie moléculaire d’une maladie donnée, et donc adaptées à celle-ci.

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  • Centre d’immunologie et des maladies infectieuses / UMRS 1135

L'UMRS 1135 (CIMI), unité de recherche SU - INSERM - CNRS, a pour objectif la compréhension des fonctions du système immunitaire dans les conditions normales et/ou pathologiques dues à des agents infectieux.
Le centre rassemble des compétences scientifiques et cliniques en formation et en recherche dans les domaines de l’immunologie, de l’inflammation, de la microbiologie, des interactions hôte-pathogène et de la vaccinologie.
Cimi-Paris est localisé à la Faculté de Médecine Sorbonne Université, à l’Hôpital de la Pitié-Salpêtrière. Cet environnement est particulièrement propice pour les collaborations cliniques dans le domaine des maladies infectieuses, des greffes, en hématologie, en immunologie, et en médecine interne.

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  • Institut Pierre Louis d’épidemiologie et de santé publique / UMRS 1136

L’institut Pierre Louis d’Epidémiologie et de Santé Publique (IPLESP) rassemble toutes les forces de recherche en épidémiologie et en santé publique de Sorbonne Université.
L’institut couvre les principaux domaines de l’épidémiologie, clinique, populationnelle ou sociale, ainsi que de la pharmacoépidémiologie, de la biostatistique, de la modélisation statistique et mathématique, de la recherche clinique, des relations entre l’environnement et la santé, des déterminants sociaux de la santé et des organisations de soins en santé.
En termes d’applications, le laboratoire traite principalement de maladies transmissibles (grippe, infection par le VIH, hépatite virale,…), d’infections nosocomiales et émergentes, de maladies chroniques (maladies chroniques inflammatoires, maladies respiratoires, allergiques et cardiovasculaires, maladies psychiatriques), de prise en charge en réanimation.

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  • Maladies rénales fréquentes et rares / UMRS 1155

L’objectif de l'UMRS 1155 est de fournir une approche translationnelle des mécanismes responsables de l’insuffisance rénale chronique afin de développer des traitements thérapeutiques efficaces et diminuer ainsi le nombre toujours croissant de patients nécessitant une dialyse.
La plupart des programmes de recherche fondamentale de l'UMRS 1155 visent à être transférés en clinique, et inversement des observations faites en clinique donnent naissance à de nouvelles hypothèses de recherche telles que la compréhension des mécanismes des maladies rares, les complications consécutives à une lésion rénale aiguë ou celles associées à la lithiase, l’identification de nouveaux biomarqueurs, ou la mise en ouvre des stratégies thérapeutiques innovantes. La recherche de l'unité dépasse les frontières de la néphrologie car elle aborde des mécanismes physiopathologiques majeurs communs tels que l’inflammation, la fibrose, le dysfonctionnement endothélial et vasculaire, ou la prolifération cellulaire anormale.

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  • Neurophysiologie respiratoire expérimentale et clinique / UMRS 1158

L’UMRS 1158 est dédiée à l’étude des relations entre le système nerveux et l’appareil respiratoire (“neurophysiologie respiratoire”). Elle mobilise pour cela des approches biologiques, histologiques, physiologiques, pharmacologiques, et cliniques -y compris psychophysiologiques- avec dans chaque cas un recours approfondi aux biomathématiques et à la modélisation.
La recherche de l'unité est hautement translationnelle, son articulation étroite avec le département R3S (“respiration, réanimation, réhabilitation, sommeil”) du Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière Charles Foix permettant des interactions bidirectionnelles entre recherche animale et recherche humaine.

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  • Unité de recherche sur les maladies cardiovasculaires, le métabolisme et la nutrition / UMR 1166

L'UMR 1166 est composée de cinq équipes dévolues à la recherche sur les maladies cardiovasculaires et métaboliques. Elle dispose d’expertises internationalement reconnues et complémentaires en génomique, biostatistique, biologie moléculaire et cellulaire, physiologie et pharmacologie.
L’unité a joué un rôle capital dans la création de l’Institut Hospitalo-Universitaire ICAN, Institute of Cardiovascular and Nutrition Diseases, l’un des six IHU créés en France, qui propose un plateau technique unique pour la recherche clinique et le matériel biologique humain dans le champ des maladies cardiovasculaires et de la nutrition.
Le projet scientifique de l'UMR 1166 s’organise autour de quatre axes principaux : athérothrombose et maladies coronariennes, génomique des cardiomyopathies et de l’insuffisance cardiaque, fibrillation atriale et arythmies cardiaques, lipides et maladies vasculaires athérosclérotiques.

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  • Nutrition et obésités: approches systémiques (nutriomics) / UMRS 1269

Le laboratoire Nutriomics mène de nombreuses recherches fondamentales et translationnelles dans le domaine de l’obésité et des troubles métaboliques associés. L'unité a pour objectifs d'explorer les perturbations du dialogue inter-organes et particulièrement le rôle du tissu adipeux et de l’intestin dans ces dialogues et d'identifier de nouveaux moyens de stratifier la maladie et de nouvelles thérapies afin d’améliorer la santé cardiométabolique.

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Les thématiques de recherche

Les domaines d'expertises au sein de l'UFR Sciences de la vie sont :

  • Biologie computationnelle
  • Biologie de la cellule
  • Biologie structurale
  • Biologie synthétique
  • Biophysique
  • Développement
  • Évolution
  • Immunologie
  • Neurosciences
  • OMIQUE
  • Physiopathologie

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