Parcours Écophysiologie et Écotoxicologie (EPET)

Ce parcours s'inscrit dans les importantes restructurations scientifiques mis en place ces dernières années autour des sciences environnementales, véritable enjeu sociétal du 21e siècle. Il s'intéresse notamment aux questions environnementales et écologiques à l’échelle des organismes. Ce sont en effet les individus / organismes qui réagissent (ou pas) en premier lieu aux perturbations de leur environnement, que celles-ci soient d’origine naturelle ou anthropique. La connaissance et l’étude des mécanismes biochimiques, physiologiques ou comportementaux mis en place par les organismes est essentielle à la compréhension des réponses à des niveaux d’organisation biologique plus élevés - populations, communautés et écosystèmes. C’est l’objet de l’écophysiologie, discipline à l’interface entre la biologie des organismes et l’écologie. Une attention particulière est portée sur le rôle des interactions entre organismes tant on comprend aujourd’hui l’importance de celle-ci dans l’élaboration de la réponse des organismes eux-mêmes.

L’essor d’une branche particulière de l’écophysiologie, l’écotoxicologie, est né de la prise de conscience de l’effet des polluants, non seulement sur la santé humaine (objet d’étude de la toxicologie), mais aussi sur la santé de l’ensemble des écosystèmes de notre planète. C’est pourquoi notre parcours y consacre une attention soutenue, y compris dans ses aspects appliqués ou réglementaires ouvrant à des emplois de niveau Bac+5.

Publié le 2/01/2020 - Mis à jour le 25/01/2022

Parcours Écophysiologie et Écotoxicologie (EPET)

Objectifs

Grâce aux UE transversales et méthodologiques de Master 1 focalisées sur les différents types d'organismes et milieux de vie et grâce à une spécialisation en Master 2 (animal/végétal/microbes, marin/continental,  expérimentation/réglementation), les enseignements dispensés par des spécialistes du domaine ont pour objectifs de :

  • former des diplômées et diplômés capables d’aborder la complexité des relations entre les organismes et leur environnement, en focalisant sur la réponse de différents types d’organismes et sur les conséquences au niveau des écosystèmes.
  • connaitre les principaux mécanismes d’acclimatation et de détoxification/résistance des organismes : plasticité du phénotype, épigénétique.
  • illustrer les différents niveaux d’approches utilisés dans un contexte environnemental, sur le terrain et/ou au laboratoire : biologie moléculaire, biochimie, physiologie, éthologie.
  • mettre en perspective les différentes contraintes abiotiques (température, lumière, salinité, eau, oxygène, polluants) et biotiques (disponibilité en nourriture, parasitisme, symbiose) dans un contexte d’anthropisation et de changement climatique.
  • faire appréhender aux étudiantes et étudiants l’importance des études écophysiologiques et écotoxicologiques à l’échelle de l’organisme dans la résolution de problématiques environnementales, industrielles et de gestion/protection des espèces et écosystèmes, dans le cadre du développement durable.

Cette formation fait intervenir de nombreux chercheurs, chercheuses, enseignants-chercheurs et enseignantes-chercheuses de Sorbonne Université développant des thèmes de recherche en écophysiologie et/ou écotoxicologie sur différents sites de SU (campus Pierre et Marie Curie à Jussieu, Stations biologiques de Roscoff, de Banyuls,...) et sur différents modèles (micro-organismes, végétaux et animaux) vivant dans des milieux aquatiques ou terrestres.

Organisation

Première année (M1)

Les enseignements sont organisés de telle sorte que les étudiantes et étudiants puissent suivre le tronc commun de la mention BEE et acquérir de façon progressive les connaissances dans les domaines de la spécialité. Le tronc commun porte sur les grandes questions environnementales, l’analyse des données et statistiques, les bases de données et la télédétection, l'anglais, l'insertion professionnelle, le droit de l'environnement et une initiation au domaine professionnel au travers d’un stage en laboratoire ou en entreprise.

Une UE Fondamentaux en Biodiversité est proposée aux étudiantes et étudiants de tous les parcours de BEE. Il est ainsi traité de l'épistémiologie et histoire des sciences environnementales, des questions sur l'évolution, sur la biodiversité actuelle et les enjeux à venir.

Les étudiantes et étudiants du parcours Écophysiologie et Écotoxicologie suivent ensuite spécifiquement les UEs « Ecophysiologie » et « Toxicologie et Ecotoxicologie ». Ces enseignements transversaux abordent les différents milieux et les différents types d’organismes dans divers contextes environnementaux. Les cours magistraux sont accompagnés de nombreux TD et heures de travaux pratiques pour former au mieux les étudiantes et étudiants aux outils de la discipline.

Les « Ateliers Méthodologiques en Ecophysiologie » présentent une palette d’outils analytiques applicables à tout type d’organisme quel que soit son milieu de vie et se formalise par quinze jours de travaux pratiques en continu. 

Le stage est de 2 mois ou plus (si rémunération) et peut se dérouler en laboratoire ou entreprise.

Deuxième année (M2)

L’offre d'UEs proposée en M2 permet à l’étudiante ou l'étudiant d’adapter sa formation à son projet professionnel. Les étudiantes et étudiants peuvent ainsi se spécialiser soit en sélectionnant une combinaison d’UEs de leur choix soit en choisissant un parcours avec des UEs prédéfinies.

Ainsi, en fonction de ce choix, il est notamment possible :

  • d'obtenir un label « Parcours végétal »
  • d’orienter plus spécifiquement son parcours vers les domaines continentaux ou marins,
  • de se spécialiser en toxicologie environnementale grâce aux UE scientifiques et professionnalisantes de la spécialité (l'(éco)toxicologie réglementaire, droit de l'environnement,etc...),
  • ou encore d’inscrire sa formation à l'international par un échange ERASMUS avec des universités partenaires ou des universités étrangères présentant des programmes de formation équivalent.

Au S3, les étudiantes et étudiants doivent choisir entre 24 et 30 ECTS dans le panel d'UE de la spécialité. Possibilité est offerte de sélectionner 6 ECTS en dehors du panel EPET (autres spécialités du master BEE, de Sorbonne Université ou extérieurs).

Au S4, les étudiantes et étudiants effectuent un stage de 30 ECTS en laboratoire ou en entreprise.

Le parcours végétal de la spécialité offre une formation centrée sur la physiologie des réponses des plantes aux contraintes de l'environnement et sur les nouvelles utilisations des végétaux en industrie ou dans leur environnement, dans le cadre du développement durable. Les principaux mécanismes du fonctionnement des végétaux et de leurs adaptations au milieu sont mis en perspective grâce des approches biochimiques, moléculaires, cellulaires et génétiques. Une attention particulière est portée aux derniers concepts et aux plus récentes innovations technologiques de la discipline (phytoremédiation, écoconstruction, éco-ingénierie végétale, trames vertes, gestion durable en agriculture, …).

Ce parcours permet l'acquisition de compétences pour les métiers de la recherche fondamentale ou appliquée, qu’elle soit publique ou industrielle, après poursuite des études en doctorat.

Le parcours végétal forme également des cadres dans le secteur des productions horticoles et agronomiques, dans les secteurs industriels impliqués dans la transformation des végétaux (agriculture et agroalimentaire durables) et dans des secteurs d’activité des collectivités territoriales et/ou de conseil (ex. évaluation de la qualité des milieux, préservation de la biodiversité, aménagement des paysages urbains,…).

Ce parcours à la carte est construit par l'étudiante ou l'étudiant en fonction de son projet professionnel. Il inclut les UEs végétales de la spécialité :

Il peut être complété par des UEs à dominante végétale d'autres spécialités ou d'autres Master de Sorbonne Université, à choisir avec l'équipe pédagogique.

Il inclut 2 stages à réaliser (un stage de 2 mois en M1-S2, un stage de 6 mois en M2-S4) dans des équipes d'accueil ou entreprises partenaires du domaine végétal.

Cette spécialisation offre une formation centrée sur la physiologie environnementale des organismes peuplant les écosystèmes continentaux (agricoles, forestiers, désertiques, urbains,…) qui subissent une pression anthropique croissante. Grâce à des approches allant du gène au comportement, ce panel d’UE vous permettra de mieux appréhender les mécanismes d’adaptation des organismes vivant dans ces  milieux et les conséquences des pollutions anthropiques sur les organismes et les relations intra et interspécifiques.

Cette spécialisation est construite à la carte par l'étudiant en fonction de son projet professionnel. Elle inclut les UE suivantes :

Elle permet ainsi  l'acquisition de compétences pour les métiers de la recherche fondamentale ou appliquée, publique ou industrielle, après poursuite des études en doctorat. Le panel d’UE peut être complété par l’UE « toxicologie réglementaire » pour acquérir une spécialisation professionnalisante et/ou par des UE choisies au sein du panel d’UE de la spécialité EPET, d’autres spécialités d’un des masters de Sorbonne Université ou d’une autre université (en concertation avec l’équipe pédagogique).

L’océan est sans nul doute le plus vaste habitat de notre Terre, et le moins connu alors que les changements globaux l’affecte directement : réchauffement, acidification, désoxygénation… Comment les organismes marins vont-ils pouvoir s’adapter à ces changements ? Un choix d’UE en M2* permet de colorier votre formation en bleu marine, en renforçant vos  connaissances concernant les organismes marins, un choix qui peut être complété soit par une UE de la spécialité Océanographie et Ecologie Marine (OEM), soit par une UE de la spécialité Biologie et Bioressources Marines (BBMa) de la mention Biologie Intégrative.

* UEs de M2 de la spécialité EPET :

Les UE Toxicologie réglementaire et Droit de l'environnement en M2 permettent de renforcer les connaissances dans ce domaine et de rendre ainsi votre formation plus attractive pour rechercher un emploi à Bac+5 sur un profil incluant l’évaluation et de la maîtrise du risque toxique.

Pour la partie scientifique, vous avez aussi la possibilité de vous spécialiser en toxicologie environnementale en sélectionnant des UE centrées sur ce thème, au sein du panel de la spécialité ou dans une autre mention grâce à votre UE libre de choix.

UE du panel EPET en toxicologie environnementale:

Public visé et prérequis

Cette formation est destinée à des étudiantes et étudiants titulaires d’un diplôme de Licence en biologie ou équivalent (coloration biologie cellulaire et physiologie, ou biologie des organismes ou écologie), possédant des connaissances solides dans les disciplines scientifiques, et souhaitant combiner approches expérimentales et enjeux environnementaux.

Les candidatures seront examinées en fonction 3 catégories de critères :

  • la qualité du dossier académique, principalement en biologie des organismes et physiologie, mais aussi dans d’autres disciplines scientifiques telle que les statistiques (niveau de formation, relevé de notes) ;
  • la pertinence et la cohérence du projet de formation (motivations et adéquation du profil du candidat ou de la candidate avec les débouchés professionnels visés) ;
  • l’expérience acquise dans le domaine de l’écophysiologie (choix des UE complémentaires, stages, activités professionnelles ou extra-professionnelles).

Débouchés

  • Recherche académique ou appliquée en institut public ou privé dans les domaines de l’écophysiologie, l’éthologie, l’écotoxicologie, l’écologie, l’environnement : chercheur ou chercheuse, enseignant-chercheur ou enseignante-chercheuse, ingénieur ou ingénieure.
  • Nouveaux métiers de l’environnement en préservation de la biodiversité, développement durable, gestion et protection des organismes en milieu naturel ou en captivité, problèmes de pollutions urbaines ou rurales (collectivités territoriales, parcs naturels et zoologiques, associations, fondations et agences publiques ou privées) : chargé ou chargée d’études, chargé ou chargée de mission, responsable environnement, responsable développement durable, écotoxicologue réglementaire.
  • Métiers de transmission du savoir (enseignement, formation, …), de diffusion des connaissances, de communication, d’animation et médiation scientifique : enseignant ou enseignante, formateur ou formatrice, journaliste.
  • Cadre des bio-industries, de l’industrie alimentaire, pharmaceutique ou chimique, responsable R&D.

Contacts

Responsables du parcours

François LALLIER 

Secrétariat

Nadia FOKA

Campus Pierre et Marie Curie
Département de SDUEE
Tour 46-00, 1er étage

Case courrier 210
4, place Jussieu
75005 Paris