Laboratoire de biologie computationnelle et quantitative | LCQB
-
Unité mixte de recherche
Le LCQB est un laboratoire interdisciplinaire travaillant à l'interface entre la biologie et les sciences quantitatives. Il est construit pour promouvoir une interaction équilibrée des approches théoriques et expérimentales en biologie et pour favoriser la définition de nouvelles questions expérimentales, l'analyse des données et la modélisation des phénomènes biologiques. Nos projets abordent des questions sur les structures et processus biologiques à travers la réalisation d’expériences de génomique fonctionnelle, d’ingénierie des génome et de biologie synthétique sur des organismes modèle (levure, micro-algue et bactérie), le séquençage des génomes, la génération in silico de nouvelles données biologiques qui restent aujourd'hui inaccessibles aux expériences, la modélisation mathématique et physique des systèmes biologiques, le développement de méthodes statistiques pour les données l'analyse, et la conception d'algorithmes originaux visant à des prédictions.
Équipes
- Analytical Genomics (Group Leader: Alessandra Carbone)
-
Biology of Genomes (Group Leader: Gilles Fischer
-
Evolution and immunology of pathogens (Group Leader: Igor Rouzine)
-
Genetic Networks (Group Leader : Frederic Devaux)
-
Mathematical Modeling in Biology (Group Leader: Delphine Salort)
-
Statistical Genomics and Biological Physics (Group Leader: Martin Weigt)
-
Synthetic and Systems Biology of Microalgae (Group Leader: Stéphane Lemair)
-
Telomere & Genome Stability (Group Leader: Zhou Xu)
Direction
-
Alessandra Carbone
Direction adjointe
-
Gilles Fischer
-
Martin Weigt
Administration
-
Mylène Jomie
-
+33 1 44 27 73 38
-
Fabienne Velter
-
+33 1 44 27 20 67
Communication
-
Fabienne Velter
-
+33 1 44 27 20 67
Tutelle hébergeante
- Sorbonne Université
Autres tutelles
- Centre National de la Recherche Scientifique | CNRS
58 membres
-
Enseignants-chercheurs : 18
-
Chercheurs : 4
-
Personnels d'appui à la recherche : 1
-
Doctorants : 19
-
Post-doctorants : 7
- Microfluidic single cell microscopy
- OXford Nanopore Sequencing
- Pulse-field gel electrophoresis
- Microdissecator
- Microalga culture room
- Computer cluster
- Logiciels
Publications
Publications sur HAL - Archive ouverte
Toutes les publications sur HALOn the Functoriality of Belief Propagation Algorithms on Finite Partially Ordered Sets
Grégoire Sergeant-Perthuis, Toby St Clere Smithe, Léo Boitel
2025. ⟨hal-04995548⟩
Fast training and sampling of Restricted Boltzmann Machines
Nicolas Bereux, Aurélien Decelle, Cyril Furtlehner, Lorenzo Rosset, Beatriz Seoane
13th International Conference on Learning Representations - ICLR 2025, Apr 2025, Singaour, Singapore. ⟨hal-04885777⟩
Strongly nonlinear age structured equation, time-elapsed model and large delays
Benoît Perthame, Delphine Salort, Clément Rieutord
2025. ⟨hal-04983584⟩
Functional recoding of Chlamydomonas reinhardtii thioredoxin type-h into photosynthetic type-f by switching selectivity determinants
Stéphane D Lemaire, Gianluca Lombardi, Andrea Mancini, Alessandra Carbone, Julien Henri
Frontiers in Plant Science, 2025, 16, ⟨10.3389/fpls.2025.1554272⟩. ⟨hal-05003715⟩
Contact details
Adresse physique
75005 Paris
Adresse postale
75005 PARIS
-
+33 1 44 27 42 52
Institut de Biologie Paris Seine
Sorbonne Université
Bâtiment C, 3ème et 4ème étages
7-9 Quai Saint Bernard 75005 Paris