M2 - Cell Biology, Development and Stem Cells course

Introduction

Contacts

Objectives

This subject aims to provide students with conceptual and methodological expertise in the field of developmental biology. The main focus of this field of research is embryo formation, but it also includes reproduction, regeneration and stem cells. Developmental biology is at the crossroads of several disciplines, including cell biology, genetics and molecular biology. Understanding the fundamental mechanisms of developmental processes can therefore be approached using these different approaches. Developmental biology also contributes to our understanding of carcinogenesis and genetic developmental diseases, and paves the way for studies into therapeutic approaches.

This subject trains young researchers to be capable of working in public or private research laboratories. It is supported by clearly identified host teams in universities and major research institutes, networks of European laboratories and several partner laboratories located abroad. The course is taught entirely in English.

Internships and mobility

A placement of up to six months in an academic research laboratory or, more rarely, in a company, enables students to perfect their practical and theoretical training while discovering their future professional environment. The primary goal is to prepare them for the pursuit of a doctorate, either in France or abroad.

Our Erasmus exchange partnerships with the European universities involved in the international Master’s programme associated with the course offer students the opportunity to study abroad (University of Lisbon, Portugal; University of Heidelberg, Germany; Pompeu Fabra University, Spain).

General organisation of teaching

The teaching is organised by a teaching team that monitors and assesses students. This team includes:

Obtaining 60 ECTS validates the M2 year and they are broken down as follows: Specialisation UE (12 ECTS), Scientific Analysis UE (6 ECTS), Scientific Project UE (6 ECTS), Opening UE (6 ECTS), Internship UE (30 ECTS).

Contacts

La biologie des cellules souches et leurs applications thérapeutiques constituent à ce jour un domaine en pleine expansion dans les sciences de la vie. Ces cellules sont dotées de deux propriétés cardinales qui les distinguent des autres cellules de l’organisme : elles sont capables de s’autorenouveler ou au contraire de s’engager dans une ou plusieurs voies de différenciation. L’identification des cellules souches et la compréhension des mécanismes moléculaires impliqués dans leur régulation constituent un enjeu primordial pour les biologistes, les cliniciennes et cliniciens intéressés par les problèmes de différenciation cellulaire, de reprogrammation cellulaire, d’homéostasie et de réparation tissulaire. La biologie des cellules souches ouvre également de nouvelles perspectives sur la compréhension des processus d’initiation de tumeurs et fait l’objet d’intenses travaux de recherche en médecine régénérative.

Cette thématique a pour ambition d’assurer une formation théorique et pratique de haut niveau dans le domaine de la biologie des cellules souches. L’enseignement sera basé sur des conférences dispensées par des spécialistes français et internationaux et d’un atelier pratique permettant d’observer et manipuler différents types de cellules souches (embryonnaires et adultes). L’objectif est donc de fournir aux étudiantes et étudiants les connaissances fondamentales permettant de comprendre la logique des cellules souches et les enjeux qui en dépendent sur les plans clinique, éthique et juridique.

Formation

La thématique "Biologie des cellules souches" s’appuie sur un enseignement de spécialisation (30 ECTS), théorique et pratique, et sur un stage d'une durée maximale de six mois qui se déroule dans un laboratoire d’accueil en France ou à l’étranger (30 ECTS). Cette thématique est intégralement enseignée en langue anglaise.

Public

Cette thématique est destinée aux étudiantes et étudiants scientifiques, ou issus du cursus médical ou pharmaceutique, ainsi qu’aux élèves des grandes écoles. Des connaissances approfondies dans les domaines de la biologie cellulaire, du développement et de la biologie moléculaire sont requises. Pour les étudiantes et étudiants inscrits en M1 dans la mention "Biologie moléculaire et cellulaire" de master, la validation de l’UE "Introduction à la Biologie des cellules souches" est souhaitable.

Débouchés

Cette thématique est destinée à former des spécialistes de haut niveau dans le domaine de la biologie des cellules souches. Il offre ainsi la possibilité aux étudiantes et étudiants de s’orienter vers les métiers de la recherche académique ou privée. Cette formation permet également de s’orienter vers d’autres métiers tels que la valorisation scientifique ou le conseil.

Comité scientifique

Contact 

Présentation générale de la thématique

La thématique "Bases moléculaires de l’oncogenèse", commune aux parcours "Biologie cellulaire, Biologie du développement & Biologie des cellules souches" et "Génétique", permet aux étudiantes et étudiants d’acquérir les notions essentielles pour comprendre les processus biologiques assurant notamment le contrôle du cycle cellulaire et le maintien de l’intégrité du génome, et comment ces processus sont altérés lors de l’initiation ou la progression tumorale. Selon l’UE de spécialisation choisie, ces aspects sont étudiés à l’échelle de la cellule ou de l’organisme entier. En alliant séminaires et travaux pratiques, les UEs de spécialisation, délivrées en partenariat avec l’Institut Pasteur et l’Institut Curie, intègrent les notions et techniques les plus récentes de la biologie, telles que (selon l’UE choisie) : 1) le peignage moléculaire pour comprendre les mécanismes d’instabilité génétique et l’immuno-précipitation de la chromatine pour analyser les relations fonctionnelles entre lésions de l’ADN et remodelage de la chromatine ; 2) le ciblage de mutations conditionnelles dans le génome de souris pour contrôler l’activation d’oncogènes ou l’inactivation de suppresseurs de tumeurs, ou encore la reprogrammation de fibroblastes en cellules souches, dont les propriétés sont voisines de celles des cellules cancéreuses ; 3) la reconstitution in vitro de fonctions cellulaires, et la visualisation des constituants cellulaires par les méthodes les plus récentes de microscopie confocale et d’imagerie dynamique, pour étudier l’organisation fonctionnelle de la cellule.

La thématique intègre 2 UE de spécialisation qui, dans leur diversité, permettent d’aborder tous les aspects de la biologie et de la génétique des tumeurs:

• Le Cours de Génétique et Epigénétique Moléculaires (MU5BM824) a pour objectif d’approfondir les aspects techniques et conceptuels de la recherche en génétique et en épigénétique, notamment dans le cadre de l’oncogenèse. Il vise à analyser les mécanismes régulant l’expression et la stabilité des génomes des cellules eucaryotes, ainsi que ceux qui contrôlent la progression dans le cycle cellulaire.
• Le Cours de Génétique de la Souris (MU5BM813) s’adresse aux étudiants souhaitant acquérir une formation complète à l’utilisation de cet animal comme système modèle des pathologies humaines, notamment le cancer. Il s’adresse également aux étudiantes et étudiants intéressés par la biologie des cellules souches (cellules ES, IPS, …) ou la biologie du développement - à ce titre, il peut être suivi par les étudiantes et étudiants des thématiques « Biologie des cellules souches » et «Biologie du développement » du parcours Biologie Cellulaire "Biologie cellulaire, Biologie du développement & Biologie des cellules souches".

Organisation Pédagogique

Les étudiantes et étudiants choisiront l’un des deux cours de spécialisation décrits ci-dessus et délivrés en partenariat avec l’Institut Pasteur. Ces UE associent également l’UE projet et comptent pour 18 ECTS.

Ils suivent également l’UE d’analyse scientifique (6 ECTS) de leur parcours de rattachement.

Ils devront compléter leur formation en choisissant 6 ECTS d’UE(s) d’ouverture prise parmi l’offre de formation de Sorbonne Université ou d’autres universités et dont le choix sera à discuter avec l’équipe pédagogique. Les modules d’ouverture conseillés dans le cadre de la thématique BMO sont les cours de l’institut Curie “Génome non-codant” (MU5BM429) (6 ECTS), “Epigénétique, chromatine et organisation du noyau” (MU5BM460) (6 ECTS)  et « Biologie cellulaire et cancer » (MU5BM222) (3 ECTS), et le cours Sorbonne Université “Microenvironnement immunitaire, apoptose et cancer” (MU5BM577) (3 ECTS) et « Prolifération et mort cellulaire » (MU5BM285) (3 ECTS).

Enfin, ils devront trouver avant fin Septembre un stage dans un laboratoire de recherche (30 ECTS). Le choix du laboratoire et du thème de stage s'effectue en concertation avec l'équipe pédagogique. La liste des équipes d'accueil et les propositions de stage peuvent être consultées sur le site internet du master BMC (accès restreint, nous consulter) et au secrétariat auprès de Carine Joseph . L’étudiante ou l'étudiant peut éventuellement effectuer son stage dans un laboratoire ne figurant pas dans cette liste sous réserve de l'accord de l'équipe pédagogique. Le stage s'étale sur toute la durée de l'année universitaire à l'exception des périodes occupées par les UE précédemment décrites. Il est validé par un rapport écrit et une soutenance qui se tient fin Juin, pour permettre aux étudiantes et étudiants qui le souhaitent de présenter les concours des écoles doctorales début Juillet.

Contacts

Introduction

Vous êtes passionnés par les organismes marins ? Vous voulez vous former pour mieux comprendre leurs particularités et les étudier afin de répondre à des questions biologiques variées (cellulaires, moléculaires, développementales, évolutives, physiologiques, etc) ? Cette thématique vous offre l’opportunité d’acquérir ces compétences à la fois d’un point de vue fondamental mais aussi d’un point de vue de la recherche appliquée, en s’appuyant sur les 3 stations marines de Sorbonne Université : Roscoff, Villefranche-sur-Mer et Banyuls-sur-Mer.
Nous proposons de former de jeunes chercheurs en sciences du vivant ayant acquis de solides bases, à la fois théoriques et expérimentales, en biologie marine afin de comprendre les concepts et mécanismes gouvernant le fonctionnement des organismes marins à différentes échelles (de la molécule ou cellule à l’organisme). De plus, cette thématique permet d’acquérir les méthodes d’étude et d’analyse propres aux organismes marins et à leur spécificité. Enfin, ce domaine de la biologie étant très transversal, la thématique aborde la biologie des organismes marins à l’aide d’approches intégrant les techniques d’omiques, de développement, de biologie de l’évolution, de biologie cellulaire et moléculaire.

Dans le milieu marin, si vous êtes plutôt intéressés.es par l'océanographie, l'écologie, les sciences de l'environnement, vous pouvez suivre les parcours « Fonctionnement des Écosystèmes Marins et Changements Globaux » et « Biodiversité et Conservation des Écosystèmes Marins » du master Sciences de la Mer.

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Formation

La thématique "Biologie Marine : de la molécule à l’organisme" s’appuie sur un enseignement de spécialisation (30 ECTS), théorique et pratique, ainsi que sur un stage long (30 ECTS) dans les laboratoires associés à la spécialité, situés en France ou à l’étranger. Cette thématique s’appuie fortement sur les 3 stations marines de Sorbonne Université donnant l’opportunité aux étudiants d’être au plus près de la recherche actuelle en biologie marine.
Les 30 ECTS d’enseignement correspondant au premier semestre du M2 permettent de former les étudiants à la maitrise des concepts et méthodes. Cette période inclut cinq unités d’enseignement. Au cours du semestre, l'ensemble des déplacements et hébergements en station est pris en charge par le master, les repas restant à la charge des étudiants.

UE de Spécialisation (12 ECTS)

Les étudiants suivront les deux UEs suivantes : 1: « Métazoaires et biologie de l’évolution » (MU5BM201, 6 ECTS – Banyuls-sur-Mer) Les cours magistraux renforcés par des travaux pratiques permettront d’étudier la biologie et la biodiversité des métazoaires. Au cours de cette UE, les étudiants aborderont des questions d’évo-dévo, de phylogénie moléculaire et verront les concepts liés à la notion d’homologie. Une part importante sera donnée aux aspects pratiques et à l’interaction avec les chercheurs de la station. Les étudiants aborderont aussi les méthodes de culture/stabulation des organismes marins animaux ainsi que les aspects réglementaires associés. 2 : « Biologie et Biotechnologie des Macroalgues » (MU5BM202, 6 ECTS- Roscoff) Les objectifs des enseignements proposés sont de transmettre des compétences et des connaissances théoriques et pratiques concernant la biologie, l’évolution, les bioressources et la biotechnologie des algues, principalement des macroalgues. Cette UE s’appuie fortement sur les recherches mises en œuvre dans la station biologique de Roscoff et permettra aussi aux étudiants d’aborder des aspects plus appliqués comme la biogénèse de produits naturels commercialement intéressants synthétisés par des algues ainsi que leur commercialisation. Le potentiel des composés naturels pour de nouvelles applications dans l‘agriculture, l‘alimentation, le fourrage, les cosmétiques, la santé et comme biocarburants sera présenté.

UE d'analyse scientifique (6 ECTS)

UE d'analyse scientifique (MU5BM051, 6 ECTS, Roscoff) Suite à des séminaires portant sur les différentes techniques omiques appliquées aux organismes marins, l'étudiant présentera oralement un article majeur et récent dans ce domaine. L'objectif est d'acquérir les méthodes de présentation de données scientifiques, partant de l'analyse des données expérimentales et allant jusqu’à leur interprétation critique, en relation avec le contexte scientifique.

UE de projet scientifique (6 ECTS)

UE de projet scientifique (MU5BM091, 6 ECTS) L'étudiante ou l'étudiant présentera un projet de thèse fictif sous la forme d’un rapport écrit (une dizaine de pages) et il défendra ce projet à l'oral. Ce projet devra obligatoirement s’intéresser à un organisme marin et pourra s’inspirer de la thématique du laboratoire où l'étudiant effectue son stage de master 2.

UE d'ouverture (6 ECTS)

Cette UE est choisie par l’étudiante ou étudiant en concertation avec l’équipe pédagogique parmi la liste d’UE proposée par le département de formation "Biologie moléculaire et cellulaire" de master ou par tout autre master de Sorbonne Université. Les cours privilégiés dans la thématique Biologie Marine sont les suivants : - Biologie du développement des organismes marins (MU5BM200 -Villefranche-sur-Mer) - Lumières et rythmes biologiques (MU5BIM07 – Banyuls-sur-Mer) - Biotests et Bioressources en Milieu Marin (MU5BEB45 – Banyuls-sur-Mer)

UE de stage (30 ECTS)

UE de stage (30 ECTS) Ce stage s'effectue dans une équipe d'accueil sous la direction d'un maître ou maîtresse de stage et en concertation avec l'équipe pédagogique. La liste des équipes d'accueil et les propositions de stage peuvent être consultées sur la plateforme Moodle accessible uniquement aux étudiantes et étudiants inscrits à la mention BMC et sont regroupées par parcours (accès restreint, nous consulter). L’étudiante ou étudiant peut éventuellement effectuer son stage dans un laboratoire ne figurant pas dans cette liste sous réserve de l'accord de l'équipe pédagogique. Le stage, d'une durée maximale de six mois (6 mois à raison de 22 jours par mois et 7h par jour soit 132 jours ou encore 924 h de stage ; consécutifs ou non), s'étale sur toute la durée de l'année universitaire à l'exception des périodes occupées par les UE précédemment décrites.

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Public

Le parcours est ouvert aux étudiantes et étudiants universitaires et des grandes écoles ayant suivi une filière de M1 en biologie ainsi qu’à toute étudiante ou étudiant doté d’une solide formation initiale dans une discipline connexe (sciences de l’ingénieur, physique, chimie,…) et ayant une forte motivation pour les sciences du vivant. Cette spécialité concerne également les étudiantes et étudiants en médecine et pharmacie et sciences vétérinaires. Elle accueille des étudiantes et étudiants étrangers.

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Débouchés

Cette formation de master 2 oriente les étudiantes et étudiants vers une carrière de chercheuse ou chercheur dans la recherche publique et privée, mais s’ouvre aussi vers des métiers variés dans les domaines de la pharmacie, des biotechnologies, de la valorisation scientifique, du financement et du conseil.

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Comité Scientifique

L'organisation des enseignements est prise en charge par une équipe pédagogique qui assure le suivi et l'évaluation des étudiantes et étudiants. Cette équipe comprend :

• Karen Pottin (SU, IBPS)
• Stéphanie Bertrand, Laurence Besseau, Sophie Sanchez-Brosseau (SU, Observatoire Océanologique de Banyuls-sur-Mer)
• Agnès Boutet, Jonas Collen, Patrick Cormier, Arnaud Tanguy (SU, Station biologique de Roscoff)
• Carine Barreau et Elisabeth Christians (SU, Institut de la Mer de Villefranche)
• Eric Quéinnec (SU, ISYEB)

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Comité Pédagogique

• Karen Pottin (SU)
• Stéphanie Bertrand (SU)
• Agnès Boutet (SU)
• Carine Barreau (SU)

Contacts